Sojusz Północnoatlantycki (NATO) jest sojuszem państw, którego członkiem są Czechy. W ramach sojuszu czeska armia uczestniczy głównie w obronie jego wschodniej flanki.
Senat zatwierdził 30 września 2026 roku projekt zagranicznych misji wojskowych, zgodnie z którym na obronę wschodniej flanki NATO w ciągu najbliższych dwóch lat może zostać wysłanych najwyżej 1600 czeskich żołnierzy, czyli o 400 mniej niż dotąd. Minister obrony Jaromír Zůna (z ramienia SPD) uzasadnił zmniejszenie oszczędnościami oraz tym, że dotychczasowy limit nie był wykorzystywany. Przewodniczący senackiej komisji obrony Pavel Fischer (z ramienia TOP 09) wyraził zastrzeżenia wobec zmniejszenia, mając na względzie politykę odstraszania [1].
Według rządu w maju 2026 roku na Słowacji, w Polsce, na Litwie i na Łotwie stacjonowało 427 czeskich żołnierzy. Projekt przewiduje także możliwe skierowanie żołnierzy do Estonii, na Węgry, do Rumunii, Bułgarii i nowo do Finlandii, zależnie od potrzeb sojuszu. Liczba żołnierzy w misji NATO w Iraku i w Kuwejcie ma się zmniejszyć z 20 do połowy tej liczby. Podobnie jak w dwóch poprzednich latach projekt umożliwia też pobyt w Czechach do 2000 żołnierzy państw członkowskich NATO. Misję miała jeszcze zatwierdzić Izba Poselska [1].
Premier Andrej Babiš (ANO 2011) przed odlotem na szczyt sojuszu w Ankarze w lipcu 2026 roku obiecał zwiększyć wydatki na obronność o 36 miliardów koron. Projekt budżetu państwa na rok 2027 przewiduje dla ministerstwa obrony wydatki w wysokości 190,86 miliarda koron wobec 154,8 miliarda w tym roku. Według Česká tisková kancelář w ostatnich miesiącach Czechy spotykały się z krytyką sojuszników za niskie wydatki na obronność i niespełnianie zobowiązania przeznaczania na obronę dwóch procent PKB [2].
Prezydent Petr Pavel oświadczył 30 września 2026 roku po rozmowach z prezydentem Rumunii Nicușorem Danem, że państwa sojuszu muszą jasno okazać determinację w obronie swojej przestrzeni powietrznej i wód przybrzeżnych. Na majowym szczycie Bukareszteńskiej Dziewiątki (B9), zrzeszającej kraje wschodniej flanki NATO, Pavel był w Rumunii [3][4].